Programme résumé

- Repliement des macromolécules biologiques : aspects cinétiques et thermodynamiques

- Détermination de la structure tridimensionnelle des macromolécules biologiques : principes des principales méthodes expérimentales (dichroïsme circulaire, Infrarouge et Raman, RMN, cristallographie et diffraction des rayons X) et modélisation moléculaire

- RMN : Principales expériences pour l’analyse structurale des protéines en solution, Caractérisation des interactions biologiques par RMN

- Apprentissage de différents outils informatiques pour l’analyse structurale et la modélisation de macromolécules biologiques

- Apprentissage de l’attribution d’un spectre RMN, stratégies d’interprétation

Approche pédagogique

- L'étudiant devra connaitre les niveaux de structuration d’une protéine et apprendre à en reconnaitre les différents motifs. Il devra comprendre les processus cinétiques et thermodynamiques du repliement des protéines, et leur application pour la détermination de structure. L’étudiant se familiarisera avec les principales banques de données de structure (PDB, KEGG), et apprendra à en utiliser les données (logiciels de modélisation moléculaires). Il maitrisera les principes des principales méthodes de détermination de structure, dont notamment la RMN

- Les cours magistraux sont accès sur l’apprentissage des connaissances nouvelles, et leur maitrise. Les travaux dirigés sont accès sur les stratégies d’interprétation des spectres RMN, et sur l’analyse de résultats d’études structurales. Trois devoirs maison (DM) et 2 travaux pratiques (TP) complètent l’apprentissage aussi bien théorique que pratique, au travers l’utilisation des outils web de biologie structurale et l’initiation à un logiciel de modélisation moléculaire professionnel

Compétences visées

- savoir : Repliement des macromolécules, méthodes d’études, RMN liquide

- savoir-faire : Analyser et décrire une structure complexe, Analyser des spectres RMN ¹H, 1D et 2D de peptides en solution, Attribuer les déplacements chimiques ¹H de peptides.

Cours sur le logiciel SPM.